يحتوي قسم علم الأمراض على مختبر مجهز تجهيزاً جيداً يستوعب 40 طالباً وطالبة في كل جلسة. ويحتوي على متحف مخصص للقسم به عينات مستخزعة جراحياً محفوظة في جِرار وعينات رطبة من مختلف نظم الأعضاء. كما يزخر بالعديد من الشرائح التعليمية الخاصة بعلم أمراض الأنسجة وعلم الخلايا وعلم أمراض الدم.
تم تجهيز المختبر بأحدث الوسائل السمعية والبصرية التي تشمل أحدث أجهزة عرض شاشات الكريستال السائل (LCD) ونظام الصوت. كما يتوفر أيضاً مجهر رقمي مزود بمرافق للتصوير وعرض الشرائح المجهرية. ويوجد بالمختبر الرئيسي غرفة ملحقة لتحضير وتركيب العينات.
يُحظى الطلاب بتقديم عرض توضيحي للعينات المستخزعة جراحياً والشرائح من تشريح المرضي وأمراض الدم المتعلقة بأمراض مختلفة خلال جلسة المختبر الخاصة بعلم الأمراض. كما يتعرف الطلاب على الجوانب العملية لعلم الأمراض وذلك بتوجيه من أعضاء هيئة التدريس ذوي الخبرة والمتمرسين. وكذلك يتم استخدام شرائح رقمية خاصة بعلم الأمراض يتم الحصول عليها من الموارد عبر الإنترنت لتعريف الدارسين بالأمراض النادرة.