يوفر مركز التوجيه والإرشاد بكليات الجامعة الوطنية خدمات توجيه وإرشاد مجانية وسرّية لجميع الطلاب الذين التحقوا بدراسة مقررات ما قبل الطب والصيدلة. حيث تجرى الاستشارات بصورة مباشرة، كما تتوفر خدمات الاستشارة الفردية والجماعية.
تتمثل رؤية مكتب خدمات الإرشاد الطلابي في مساعدة الطلاب في الانتقال من مرحلة المدرسة الثانوية العليا إلى الكلية نحو الدورات المهنية التي تتطلب التزاماً أكبر من الطلاب لضمان النجاح. يعقد مركز التوجيه والإرشاد جلسات تتعلق بالمهارات الدراسية للمبتدئين في البرنامج التأسيسي بما يلبي احتياجاتهم العقلية والاجتماعية والشخصية.

يشمل نوع الخدمات التعامل مع: حالات القلق الناجم عن الامتحانات، والاكتئاب، وإدارة الغضب، وإدارة الوقت، وإدارة الإجهاد، والنمو الشخصي، ومشاكل الذاكرة، والمشاكل السلوكية، والمهارات الاجتماعية، ومشاكل العلاقات مع الأقران، وجلسات مهارات الدراسة للمبتدئين. وفي بعض الأحيان، تتم إحالة الطلاب إلى الخدمات النفسية والطبية، إذا تطلب الأمر، حيث يتم تحويلهم إلى قسم العلوم السلوكية والطب النفسي في مستشفى جامعة السلطان قابوس.

ينظم مكتب الخدمات الاستشارية حملات وورش عمل ومحاضرات توعية حول مشاكل المجتمع. ويقوم بإجراء اختبارات القياس النفسي لمساعدة الطلاب على إدراك نقاط القوة والضعف لديهم وكذلك تحديد المجالات التي تكتنفها المشاكل. يمكن إجراء الإحالات من قبل أعضاء هيئة التدريس أو الموظفين أو الإدارة من خلال تعبئة استمارة الإحالة، ويجب طباعة نموذج الإحالة وتعبئة التفاصيل ذات الصلة وتوقيعها وتقديمها إلى مكتب المستشار